Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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