Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP2Q13309 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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