Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RPA4Q13156 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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