Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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