Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H3Q13133 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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