Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAF1AQ13111 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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