Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT88Q13099 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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