Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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