Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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