Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 ATG38YLR211C 681 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 FLD1YLR404W 858 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 SME1YOR159C 285 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YOR366WYOR366W 354 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 CUP9YPL177C 921 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 ORC4YPR162C 1590 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 URK1YNR012W 1506 nt4.05□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 ATG26YLR189C 3597 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 RPL13AYDL082W 600 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 CWC2YDL209C 1020 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 RAV2YDR202C 1056 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 SOL4YGR248W 768 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 ASC1YMR116C 960 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 TMC1YOR052C 453 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YCL007CYCL007C 393 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 USA1YML029W 2517 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YND1YER005W 1893 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 AIP1YMR092C 1848 nt4.04□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 CTR86YCR054C 1692 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 TSC13YDL015C 933 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YDL094CYDL094C 510 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YDR220CYDR220C 294 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 SCM4YGR049W 564 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YGR115CYGR115C 780 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 MTM1YGR257C 1101 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 YNL013CYNL013C 378 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 RRG7YOR305W 729 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 RPS11BYBR048W 471 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 CDC6YJL194W 1542 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 SRS2YJL092W 3525 nt4.03□□□□□ -1.76
LCB4Q12246 PIM1YBL022C 3402 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 WBP1YEL002C 1293 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 NIS1YNL078W 1224 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MFM1YPL060W 1242 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MRPL51YPR100W 423 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 HPA2YPR193C 471 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 TEL1YBL088C 8364 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YPK9YOR291W 4419 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SSL1YLR005W 1386 nt4.02□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 VPS38YLR360W 1320 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YOS1YER074W-A 258 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YFR045WYFR045W 930 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RPS25AYGR027C 327 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GTR2YGR163W 1026 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CKA1YIL035C 1119 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MMF1YIL051C 438 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YLR217WYLR217W 324 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RPL18BYNL301C 561 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YPL077CYPL077C 723 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PHO84YML123C 1764 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YCF1YDR135C 4548 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YBR225WYBR225W 2703 nt4.01□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 BBC1YJL020C 3474 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PFK1YGR240C 2964 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YOR365CYOR365C 2112 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 DSL1YNL258C 2265 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 TPA1YER049W 1935 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GUK1YDR454C 564 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 APA2YDR530C 978 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 EFG1YGR271C-A 702 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 IST3YIR005W 447 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GPX1YKL026C 504 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YKL131WYKL131W 522 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RPS30AYLR287C-A 192 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 TRM112YNR046W 408 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 FIG1YBR040W 897 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MCM16YPR046W 546 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SMP3YOR149C 1551 nt4□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CIK1YMR198W 1785 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PRS5YOL061W 1491 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GLN4YOR168W 2430 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PHO13YDL236W 939 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RPC11YDR045C 333 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 ATC1YDR184C 885 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MSW1YDR268W 1140 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PSF3YOL146W 585 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RAS1YOR101W 930 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CAF20YOR276W 486 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MUD1YBR119W 897 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SSB1YDL229W 1842 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 AVT1YJR001W 1809 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 BUD6YLR319C 2367 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PPQ1YPL179W 1650 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RRN11YML043C 1524 nt3.99□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SSH1YBR283C 1473 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CUE3YGL110C 1875 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 HOM3YER052C 1584 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SPH1YLR313C 1593 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RPO21YDL140C 5202 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 ARP9YMR033W 1404 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CHL1YPL008W 2586 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YRA2YKL214C 612 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YKR051WYKR051W 1257 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SIW14YNL032W 846 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 UBX5YDR330W 1503 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MDM30YLR368W 1797 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 TRS85YDR108W 2097 nt3.98□□□□□ -1.77
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