Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 SRP1YNL189W 1629 nt6.83□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 KRE2YDR483W 1329 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 NOT5YPR072W 1683 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YGR153WYGR153W 654 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 MIC26YGR235C 702 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YJL202CYJL202C 348 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 TAF9YMR236W 474 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 ULA1YPL003W 1389 nt6.82□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YLR152CYLR152C 1731 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 SEC53YFL045C 765 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YFL064CYFL064C 525 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 RPL40AYIL148W 387 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 DAD3YBR233W-A 285 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 VBA2YBR293W 1425 nt6.81□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 VHR1YIL056W 1923 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 TFB3YDR460W 966 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YHL018WYHL018W 363 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 ERD2YBL040C 660 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 MIM1YOL026C 342 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 MDM38YOL027C 1722 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 snR49snR49 165 nt6.8□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 CEM1YER061C 1329 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YDR187CYDR187C 519 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 CTF8YHR191C 402 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 NBL1YHR199C-A 222 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 RMP1YLR145W 606 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 PRE5YMR314W 705 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 INA17YPL099C 549 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 SMF2YHR050W 1650 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YJL016WYJL016W 1686 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 GGA2YHR108W 1758 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 PAP2YOL115W 1755 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 STP2YHR006W 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 ORC2YBR060C 1863 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 MSY1YPL097W 1479 nt6.79□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 CLB1YGR108W 1416 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 GPI8YDR331W 1236 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YDR431WYDR431W 312 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 UTR5YEL035C 501 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YGL193CYGL193C 312 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 YIR035CYIR035C 765 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 RPL8BYLL045C 771 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 RPS19AYOL121C 435 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 MCD1YDL003W 1701 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 HXK2YGL253W 1461 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 BAP3YDR046C 1815 nt6.78□□□□□ -1.32
WSC3Q12215 IXR1YKL032C 1794 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 MSA1YOR066W 1890 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 TFB5YDR079C-A 219 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 HIS5YIL116W 1158 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YPR114WYPR114W 948 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 DER1YBR201W 636 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 MET30YIL046W 1923 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 KAR9YPL269W 1935 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 VPS73YGL104C 1461 nt6.77□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YNL095CYNL095C 1929 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YDL211CYDL211C 1119 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YFR056CYFR056C 369 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 SMD1YGR074W 441 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 PSP2YML017W 1782 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 BUD7YOR299W 2241 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 BIO3YNR058W 1443 nt6.76□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 DBP3YGL078C 1572 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YDR467CYDR467C 327 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YEL067CYEL067C 588 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 LCL3YGL085W 825 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YLR462WYLR462W 609 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 RNA170RNA170 169 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 HBS1YKR084C 1836 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 COX1Q0045 1605 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YMR279CYMR279C 1623 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 CUE3YGL110C 1875 nt6.75□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 LCB2YDR062W 1686 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 HAP4YKL109W 1665 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 HRD1YOL013C 1656 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 TEF1YPR080W 1377 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 TEF2YBR118W 1377 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 RPL18BYNL301C 561 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 CDC7YDL017W 1524 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 YLL032CYLL032C 2478 nt6.74□□□□□ -1.33
WSC3Q12215 AGP3YFL055W 1677 nt6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms