Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 PIB1YDR313C 861 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 DDI2YFL061W 678 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 CDC26YFR036W 375 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 CAB2YIL083C 1098 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 YAL004WYAL004W 648 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 YJL175WYJL175W 513 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 MBB1YJL199C 327 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 ATG16YMR159C 453 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 DDI3YNL335W 678 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 ATG29YPL166W 642 nt3.34□□□□□ -1.87
YPQ1Q12010 CLG1YGL215W 1359 nt3.34□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YTM1YOR272W 1383 nt3.34□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RIT1YMR283C 1542 nt3.34□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SKP2YNL311C 2292 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RPA135YPR010C 3612 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 DSN1YIR010W 1731 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SRO7YPR032W 3102 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 NKP1YDR383C 717 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 WBP1YEL002C 1293 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YGR018CYGR018C 330 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YIL025CYIL025C 375 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MTD1YKR080W 963 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RPF2YKR081C 1035 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YLR012CYLR012C 300 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 TPM1YNL079C 600 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YNL320WYNL320W 855 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YBR096WYBR096W 693 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YIG1YPL201C 1386 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 STE6YKL209C 3873 nt3.33□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 UTP25YIL091C 2166 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 GRX3YDR098C 858 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RNH202YDR279W 1053 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 IRC9YJL142C 393 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 NEJ1YLR265C 1029 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 GOT1YMR292W 417 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 CYC2YOR037W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 UAF30YOR295W 687 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PST1YDR055W 1335 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RTG3YBL103C 1461 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 HAP4YKL109W 1665 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 DAP2YHR028C 2457 nt3.32□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 NRP1YDL167C 2160 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YGR117CYGR117C 1431 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YTA7YGR270W 4140 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PHM6YDR281C 315 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 DCG1YIR030C 735 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PET130YJL023C 1044 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 HOT13YKL084W 351 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 HYM1YKL189W 1200 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 IES3YLR052W 753 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RPS10BYMR230W 318 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 IAH1YOR126C 717 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PNT1YOR266W 1272 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 BTS1YPL069C 1008 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YPL168WYPL168W 1293 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 STE23YLR389C 3084 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SEG1YMR086W 2883 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 TSR1YDL060W 2367 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YPR003CYPR003C 2265 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 NOP4YPL043W 2058 nt3.31□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MDM10YAL010C 1482 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 NEM1YHR004C 1341 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 KEG1YFR042W 603 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YGR107WYGR107W 450 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 BCD1YHR040W 1101 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MRPL49YJL096W 486 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 ALB1YJL122W 528 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 ACK1YDL203C 1872 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 GPI10YGL142C 1851 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 KRE5YOR336W 4098 nt3.3□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SLI1YGR212W 1407 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SYT1YPR095C 3681 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 CUE3YGL110C 1875 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PRM15YMR278W 1869 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SPT6YGR116W 4356 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 FCF1YDR339C 570 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 PAN5YHR063C 1140 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MAK16YAL025C 921 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 SAW1YAL027W 786 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 COA4YLR218C 453 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 REH1YLR387C 1299 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 ERG2YMR202W 669 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 HSH49YOR319W 642 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 ARO1YDR127W 4767 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YKR015CYKR015C 1707 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MIC60YKR016W 1623 nt3.29□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 ASI1YMR119W 1875 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MDN1YLR106C 14733 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 RRP14YKL082C 1305 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MNL1YHR204W 2391 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 CTH1YDR151C 978 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YGR026WYGR026W 837 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 AIM23YJL131C 1071 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YBL096CYBL096C 309 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YOL162WYOL162W 648 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 snR17asnR17a 333 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 MUM2YBR057C 1101 nt3.28□□□□□ -1.88
YPQ1Q12010 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms