Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms