Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms