Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms