Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP3CAQ08209 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP3CAQ08209 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms