Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
COL16A1Q07092 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms