Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME1Q06323 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms