Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEUP1Q05D60 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEUP1Q05D60 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms