Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ID3Q02535 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ID3Q02535 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ID3Q02535 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ID3Q02535 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms