Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A2Q01362 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms