Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms