Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP1Q00587 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP1Q00587 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms