Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC5Q00444 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms