Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD1P98174 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD1P98174 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD1P98174 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD1P98174 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms