Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EFNB1P98172 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms