Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms