Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIM1P81133 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIM1P81133 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIM1P81133 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIM1P81133 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIM1P81133 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms