Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP46P62068 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP46P62068 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP46P62068 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP46P62068 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP46P62068 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP46P62068 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP46P62068 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP46P62068 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms