Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms