Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms