Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXCT1P55809 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms