Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL23P55773 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL23P55773 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms