Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52P55327 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52P55327 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms