Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP7P55210 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP7P55210 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP7P55210 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP7P55210 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP7P55210 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms