Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms