Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD23AP54725 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD23AP54725 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms