Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A3P53794 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms