Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M2P53677 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms