Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms