Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-5P52952 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms