Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCNKBP51801 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLCNKBP51801 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms