Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC3P51654 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC3P51654 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPC3P51654 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC3P51654 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC3P51654 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms