Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA4P51532 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA4P51532 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms