Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DAP3P51398 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DAP3P51398 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DAP3P51398 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DAP3P51398 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DAP3P51398 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms