Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBP50607 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBP50607 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBP50607 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBP50607 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBP50607 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBP50607 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBP50607 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBP50607 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBP50607 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms