Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSRP3P50461 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSRP3P50461 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSRP3P50461 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSRP3P50461 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSRP3P50461 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSRP3P50461 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms