Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATMP50440 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATMP50440 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATMP50440 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATMP50440 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATMP50440 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATMP50440 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATMP50440 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATMP50440 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATMP50440 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATMP50440 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATMP50440 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATMP50440 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATMP50440 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATMP50440 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms