Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSK3BP49841 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms