Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms